Основной бизнес холдинга — производство минеральных удобрений. Лидер в производстве  фосфорных удобрений.

В состав холдинга входят:

• ОАО «Апатит» (Кировск, Мурманская область) — крупнейший производитель апатитового концентрата в России;
• ОАО «ФосАгро-Череповец» (Череповец) — крупнейшее в России предприятие по производству фосфорсодержащих и азотных удобрений;
• ООО «Балаковские минудобрения» (Балаково);
• ЗАО «Агро-Череповец»
• ООО «ФосАгро-Транс» (Санкт-Петербург) — транспортно-экспедиторская компания;
• ООО «ФосАгро-Регион»;
• ОАО «НИИ по удобрениям и инсектофунгицидам имени Самойлова» (Москва).

Крупнейшие благотворительные программы «ФосАгро»:

• Совместно с Госкомспортом России и Государственным центром образования «Самбо-70» «ФосАгро» реализует программу «ДРОЗД» («Дети России образованны и здоровы»). В городах, где расположены предприятия компании, на базе местных учреждений среднего образования открыты спортивно-образовательные центры; их программы гармонично сочетают традиционный курс школьного обучения, спортивные и оздоровительные программы.   

• Компания выплачивает стипендии отличникам учебы и аспирантам в тех городах, где расположены предприятия «ФосАгро».  

• В Кировске и Апатитах при поддержке «ФосАгро» и Федерации Интернет образования созданы Центры повышения квалификации преподавателей школьных учреждений. Программа рассчитана на учителей всей Мурманской области.

• На базе общеобразовательной школы №3 города Апатиты при содействии «ФосАгро» открыт Центр для детей-инвалидов.   

• В целях популяризации здорового образа жизни «ФосАгро» ежегодно проводит Спартакиады трудящихся, в которых принимают участие команды всех предприятий холдинга, а также Хибинский фестиваль физкультуры и спорта. Фестиваль художественной самодеятельности «Звезды "ФосАгро”» способствует росту творческого потенциала работников предприятий холдинга.